Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms