Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms