Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC8P31273 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms