Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms