Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms