Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CXCL2P19875 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms