Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms