Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ZBED1O96006 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZBED1O96006 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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