Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms