Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms