Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSI1O43347 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSI1O43347 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSI1O43347 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSI1O43347 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms