Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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