Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLRF2D3W0D1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms