Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms