Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFIP11Q9UBB9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms