Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.2 ms