Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ACTR3CQ9C0K3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms