Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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