Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms