Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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USP13Q92995 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP13Q92995 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP13Q92995 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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