Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHC3Q92529 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHC3Q92529 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms