Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms