Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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SYT9Q86SS6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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