Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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