Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WDR44Q5JSH3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms