Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TTLL9Q3SXZ7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TTLL9Q3SXZ7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TTLL9Q3SXZ7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TTLL9Q3SXZ7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TTLL9Q3SXZ7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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