Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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GRIK4Q16099 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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