Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms