Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.068e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.149e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.892e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 SLC16A1-AS1-205ENST00000435800 1194 ntTSL 318.97■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 SLC16A1-AS1-203ENST00000420168 900 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.453e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.733e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.488e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-201ENST00000369973 2358 ntTSL 524.02■■□□□ 1.448e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.28e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-208ENST00000444230 1125 ntTSL 515.99■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.528e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 SORL1-209ENST00000530365 983 ntTSL 59.45□□□□□ -0.96e-13■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)28.19■■■□□ 2.11e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.651e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.541e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.531e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.351e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 220.91■□□□□ 0.941e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.851e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 513.3□□□□□ -0.281e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.41e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.951e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 UNC5CL-203ENST00000470102 644 ntTSL 517.05■□□□□ 0.329e-11■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 LAD1-205ENST00000503578 582 ntTSL 58.89□□□□□ -0.992e-8■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DHX34-204ENST00000486327 2897 ntTSL 517.87■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DHX34-203ENST00000471451 426 ntTSL 55.78□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-207ENST00000555762 5573 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.729e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.759e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.989e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-203ENST00000553400 618 ntTSL 38.41□□□□□ -1.069e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.119e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.139e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.169e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.199e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 DDX24-204ENST00000553451 486 ntTSL 34.59□□□□□ -1.679e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-7■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.1□□□□□ -1.279e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.349e-10■■□□□ 11.4
PCBP2Q15366 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.454e-6■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-9■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-216ENST00000641856 2619 nt17.26■□□□□ 0.351e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-212ENST00000641427 1411 nt13.47□□□□□ -0.251e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-203ENST00000582171 1372 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-210ENST00000641305 3315 nt11.94□□□□□ -0.51e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PNPO-214ENST00000641703 1131 nt11.43□□□□□ -0.581e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.222e-16■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 320.87■□□□□ 0.933e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 319.6■□□□□ 0.733e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 219.26■□□□□ 0.673e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.592e-16■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-215ENST00000588702 622 ntTSL 218.22■□□□□ 0.513e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 317.43■□□□□ 0.383e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-207ENST00000585608 848 ntTSL 317.34■□□□□ 0.373e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-206ENST00000585460 680 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-205ENST00000585427 557 ntTSL 413.79□□□□□ -0.23e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.79□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-220ENST00000592194 556 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-218ENST00000589309 407 ntTSL 312.21□□□□□ -0.453e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 211.96□□□□□ -0.493e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.853e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-219ENST00000589480 549 ntTSL 29.23□□□□□ -0.933e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.06□□□□□ -0.963e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-210ENST00000585981 995 ntTSL 58.07□□□□□ -1.123e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 ZCCHC2-203ENST00000585949 2429 ntTSL 27.99□□□□□ -1.132e-16■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 PRKAR1A-208ENST00000585815 553 ntTSL 57.95□□□□□ -1.143e-10■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-16■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 ZCCHC2-205ENST00000587612 353 ntTSL 24.66□□□□□ -1.662e-16■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 TMEM214-211ENST00000475258 927 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-12■□□□□ 11.3
PCBP2Q15366 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-9■□□□□ 11.3
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