Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms