Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SSPNQ14714 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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