Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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