Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ITGB3BPQ13352 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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