Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM28Q13263 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM28Q13263 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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