Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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