Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRJQ12913 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRJQ12913 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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