Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC10A2Q12908 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms