Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TROQ12816 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TROQ12816 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TROQ12816 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TROQ12816 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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