Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms