Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms