Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms