Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms