Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HBBP68871 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HBBP68871 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms