Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms