Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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