Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms