Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSCP56915 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSCP56915 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms