Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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WNT3AP56704 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
WNT3AP56704 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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WNT3AP56704 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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WNT3AP56704 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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WNT3AP56704 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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WNT3AP56704 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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WNT3AP56704 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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WNT3AP56704 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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WNT3AP56704 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
WNT3AP56704 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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