Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms