Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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